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探偵のふくろうだホー。個人型確定拠出年金の掛金は、年末調整で控除を調べてもらえる手がかりのひとつホー。証明書がなければ調べがつかないホー。手順を順にたどるホー。
この記事では、個人型確定拠出年金（iDeCo）に加入している会社員が、掛金の所得控除を年末調整で受けるまでの手順を整理します。分かることは、控除の対象になる掛金、証明書の届く時期、申告書の書き方、証明書の付け方、届かないときの確かめ方です。特定の金融機関や商品、加入をすすめるものではありません。内容は2026年10月25日時点で確認した国税庁と国民年金基金連合会の公表資料に基づきます。
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掛金はどの控除になり、何を用意するのか
国税庁のタックスアンサー（No.1135、令和8年4月1日現在法令等）によると、個人型確定拠出年金の掛金は「小規模企業共済等掛金控除」の対象です。この控除の対象になる掛金は、次の3種類です。
- 小規模企業共済法の共済契約の掛金（独立行政法人中小企業基盤整備機構と結んだ契約。旧第二種共済契約の掛金は、この控除ではなく生命保険料控除の対象）
- 確定拠出年金法の掛金（企業型年金加入者掛金と個人型年金加入者掛金。個人型がiDeCo）
- 心身障害者扶養共済制度の掛金（地方公共団体が条例で実施する制度）
控除できる金額は、その年に支払った掛金の全額です。ただし、所得から差し引く金額なので、税額が掛金の額だけ減るわけではありません。
控除を受けるには、支払った掛金の証明書、または電磁的記録印刷書面（二次元バーコード付きの出力書面）が必要です。年末調整で受ける場合は、勤務先に出す「給与所得者の保険料控除申告書」に、この証明書等を添付するか、提示します。
控除が受けられることと、この年金の運用の結果は、別の話です。この点は、姉妹サイトの「iDeCoは2026年12月から何が変わる？質問と答え」でも、次のように説明しています。
運用の結果によって受け取る額は変わり、元本が保証されるものではありません。
この記事は、税の手続きだけを扱います。自営業の方は、勤務先の年末調整ではなく確定申告で控除を受けます。
年末調整で控除を受ける5つの手順
会社員が年末調整で掛金の控除を受ける流れです。提出期限や方法は勤務先ごとに決まっているため、勤務先の案内が最優先です。
- 掛金の払い込み方を確かめる：自分の口座から引き落とされる方式か、勤務先が給与から差し引いて払い込む方式（事業主払込）かを確かめます。国税庁の記載例では、給与から差し引かれた掛金は申告書に記載しません。国民年金基金連合会の証明書の案内も、事業主払込を行っている第2号加入者を除く形で書かれています。どちらの方式かは、勤務先の担当部署に聞きます。
- 証明書を用意する：国民年金基金連合会から届くハガキ、または電子データです。届く時期は次の章で確認します。
- 申告書に金額を書く：「給与所得者の保険料控除申告書」の「小規模企業共済等掛金控除」の枠に、証明書に書かれた金額を書きます。
- 証明書を付ける：ハガキの場合は、決まったページを切り取って申告書に添付します。電子データは、勤務先の指示に従います。
- 期限までに勤務先へ提出する：国税庁の案内では、申告書の提出時期は「その年最後に給与等の支払を受ける日の前日まで」です。実際の締め切りは、勤務先がそれより早く設定している場合があるため、案内の日付を確かめます。
探偵さん、証明書がまだ手元にないんですが、先に申告書を書いてもいいですか？
金額は証明書に書かれたものを使うホー。届いてから書くのが、いちばん間違いが少ないホー。
自分で金額を計算してもいいですか？
年の途中で掛金を変えた人もいるホー。証明書の金額を写すほうが安全ホー。
証明書はいつ届くのか｜令和8年分の発行時期
国民年金基金連合会の案内によると、令和8年分の小規模企業共済等掛金払込証明書（控除証明書）は、10月に一括で発行され、その後に追加発行があります。
| 発行の種類 | ハガキの発送予定日 | 電子データの発行予定日 | 主な対象 |
|---|---|---|---|
| 一括発行 | 10月23日 | 10月21日より順次 | 当年1月から9月までに払い込みの実績があった人など |
| 追加発行① | 11月25日 | 11月20日 | 当年10月に初回の払い込みがあった人、金額に変更が生じた人など |
| 追加発行② | 12月22日 | 12月18日 | 当年11月に初回の払い込みがあった人、金額に変更が生じた人など |
| 追加発行③ | 令和9年1月22日 | 令和9年1月20日 | 当年12月に初回の払い込みがあった人、年内の最後の引き落としができなかった場合など |
一括発行の証明書の金額は、当年1月から9月に払い込まれた金額です。10月から12月の分は「払込予定金額」で、まだ払い込みが終わっていません。
新規に加入した人は、時期によって届く回が変わります。国民年金基金連合会のよくある質問では、10月に初回の引き落としがあった場合は、11月下旬に発行されると案内されています。年末調整の締め切りと発行日を、早めに見比べておきます。
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申告書のどこに書き、証明書をどう付けるか
国税庁の令和8年分の記載例では、「小規模企業共済等掛金控除」の枠に、次の欄があります（ほかに、心身障害者扶養共済制度の掛金の欄もあります）。
- 確定拠出年金法に規定する個人型年金加入者掛金
- 独立行政法人中小企業基盤整備機構の共済契約の掛金
- 確定拠出年金法に規定する企業型年金加入者掛金
iDeCoの掛金は、国民年金基金連合会のよくある質問によると、「確定拠出年金法に規定する個人型年金加入者掛金」の欄に合計金額を書きます。記載例には、あなたが直接支払った掛金を書くと説明されています。記載欄が足りない場合は、適宜の様式に書いて付けます。
ハガキの証明書を付けるとき
国民年金基金連合会のよくある質問では、左上に「重要」と書かれた控除証明書のページ（いちばん右側のページ）を切り取って付けるよう案内しています。
電子データの証明書を使うとき
「マイナポータル利用」とは、マイナポータル経由で控除証明書のデータを取得し、申告書の項目へ自動で入力する仕組みです。国民年金基金連合会の案内では、マイナンバーカードを持つ人が、事前に「e-私書箱」のアカウントを作ると、電子ファイルが発行されます。アカウントの開設後に交付されると案内されています。
電子ファイルを印刷しても、ハガキと同じようには使えません。書面で提出したいときは、国税庁のe-Taxが提供する「QRコード付証明書等作成システム」で、提出できる書類を作る形です。
探偵さん、ハガキが追加で届いたら、どれを出せばいいんですか？
追加発行は、前回から金額が変わった人などに出るホー。どれを出すかは、勤務先に聞くホー。
対象かどうかは、どこで分かりますか？
さっきの表で確かめるホー。迷ったら担当の人に聞くのが近道ホー。
つまずきやすい点と、確かめ先
国民年金基金連合会のよくある質問から、つまずきやすい点を整理します。
- 引き落としができなかった月：残高不足などで掛金が引き落とされなかった月の掛金は、追納できません。たとえば、12月に年1回の引き落としを設定していて、年内の最後の引き落としができなかった場合、掛金額0円の控除証明書は発行されません。年末調整のときに引き落とし予定の証明書で出していた場合は、確定申告で修正申告することになると案内されています。
- 掛金額を変えた：各種の変更届を運営管理機関に出せば、変更を反映した証明書が発行されます。発行される月は手続きの状況によるため、国民年金基金連合会に確認します。
- 届かない、なくした：運営管理機関に再発行を依頼します。運営管理機関が受け付けてから、2週間程度かかります。一括発行後は、当年分を含めて過去5年分まで再発行できます。
国税庁のタックスアンサーによると、この控除は確定申告書の該当欄に書き、証明書等を添付または提示して受けることもできます。年末調整で受けそびれたときの扱いは、勤務先と所轄の税務署に確かめてください。
探偵さん、12月の引き落としができなかったら、年末調整はやり直しですか？
連合会の案内では、確定申告で修正申告する形になるホー。口座の残高は先に確かめておくホー。
掛金を払えなかった月は、あとから払えますか？
引き落とされなかった月の掛金は、追納できないホー。ここは気をつけたいところホー。
まとめ
- 個人型確定拠出年金の掛金は「小規模企業共済等掛金控除」の対象で、その年に支払った掛金の全額が控除できる。年末調整では「給与所得者の保険料控除申告書」に書き、証明書等を付ける。
- 令和8年分の証明書は、10月に一括発行され、11月、12月、令和9年1月に追加発行がある。10月から12月の分は払込予定金額で書かれる。
- 申告書は「個人型年金加入者掛金」の欄に合計金額を書き、ハガキは「重要」と書かれたページを付ける。事業主払込で給与から差し引かれた掛金は書かない。
日程や制度は見直されることがあります。最新の案内を確認してください。
この記事は国税庁と国民年金基金連合会の公表資料を一般向けに整理したもので、個別の税務相談ではなく、特定の金融機関や商品、加入をすすめるものでもありません。掛金の払い込み方式、提出の期限や方法、証明書の扱いなどの具体的な判断は、勤務先の経理・総務の担当者、加入している運営管理機関、国民年金基金連合会、所轄の税務署、税理士などにご確認ください。最終的な判断は専門家や所管の窓口にご確認ください。